Проект создан при поддержке факультетов ВМиК и психологии МГУ, а также Стэнфордского университета. Название — Nigma (один из родов пауков семейства Dictynidae, en:Nigma) было выбрано по ассоциации со Всемирной паутиной.
Nigma осуществляет поиск как по своему индексу, так и по индексам Google, Yahoo, Bing, Яндекс, Rambler, AltaVista, Aport.
На основе введённого пользовательского запроса Нигма формирует список документов, разделённых на несколько множеств (кластеров). Пользователь может уточнить в каком множестве продолжить поиск, тем самым улучшив релевантность результатов поиска. Пользователь также может исключить ненужные ему множества сайтов, например, документы, пришедшие с интернет-магазинов (для них формируется специальный кластер).
Список кластеров выводится слева от списка результатов поиска. Для каждого кластера указывается образующая его фраза и количество документов в кластере. Пользователь может управлять кластерами при помощи специальных ссылок под списком кластеров.